MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014002	TA	3	6	310044	310049	50 %	50 %	0 %	0 %	294494972
6002	NC_014002	A	7	7	310108	310114	100 %	0 %	0 %	0 %	294494972
6003	NC_014002	AT	3	6	310136	310141	50 %	50 %	0 %	0 %	294494972
6004	NC_014002	T	7	7	310162	310168	0 %	100 %	0 %	0 %	294494972
6005	NC_014002	TTCTGA	2	12	310188	310199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294494972
6006	NC_014002	ATG	2	6	310229	310234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494972
6007	NC_014002	TGCA	2	8	310284	310291	25 %	25 %	25 %	25 %	294494972
6008	NC_014002	ACG	2	6	310307	310312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494972
6009	NC_014002	CTC	2	6	310335	310340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494972
6010	NC_014002	TTC	2	6	310424	310429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494972
6011	NC_014002	TGCT	2	8	310632	310639	0 %	50 %	25 %	25 %	294494972
6012	NC_014002	TTA	2	6	310656	310661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494972
6013	NC_014002	GAT	2	6	310702	310707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494972
6014	NC_014002	TTG	2	6	310751	310756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494972
6015	NC_014002	GAT	2	6	310846	310851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494972
6016	NC_014002	T	7	7	310980	310986	0 %	100 %	0 %	0 %	294494972
6017	NC_014002	TTTG	2	8	311005	311012	0 %	75 %	25 %	0 %	294494972
6018	NC_014002	GA	3	6	311035	311040	50 %	0 %	50 %	0 %	294494972
6019	NC_014002	TTG	2	6	311046	311051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494972
6020	NC_014002	TTAG	2	8	311062	311069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014002	TATT	2	8	311102	311109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_014002	ATT	2	6	311120	311125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_014002	AGA	2	6	311195	311200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494973
6024	NC_014002	T	6	6	311255	311260	0 %	100 %	0 %	0 %	294494973
6025	NC_014002	CTG	2	6	311347	311352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494973
6026	NC_014002	TCCA	2	8	311359	311366	25 %	25 %	0 %	50 %	294494973
6027	NC_014002	GCA	2	6	311373	311378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494973
6028	NC_014002	CGATG	2	10	311427	311436	20 %	20 %	40 %	20 %	294494973
6029	NC_014002	AT	3	6	311596	311601	50 %	50 %	0 %	0 %	294494973
6030	NC_014002	AGG	2	6	311618	311623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494973
6031	NC_014002	TAG	2	6	311630	311635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494973
6032	NC_014002	GCA	2	6	311780	311785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494973
6033	NC_014002	A	7	7	311833	311839	100 %	0 %	0 %	0 %	294494973
6034	NC_014002	A	7	7	311932	311938	100 %	0 %	0 %	0 %	294494973
6035	NC_014002	CTT	2	6	312024	312029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494974
6036	NC_014002	TGGTA	2	10	312100	312109	20 %	40 %	40 %	0 %	294494974
6037	NC_014002	CTG	3	9	312115	312123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494974
6038	NC_014002	ATT	2	6	312226	312231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494974
6039	NC_014002	CTT	2	6	312288	312293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494974
6040	NC_014002	CAT	2	6	312373	312378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494974
6041	NC_014002	GCT	2	6	312380	312385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494974
6042	NC_014002	GT	3	6	312510	312515	0 %	50 %	50 %	0 %	294494974
6043	NC_014002	TC	3	6	312526	312531	0 %	50 %	0 %	50 %	294494974
6044	NC_014002	TTC	2	6	312565	312570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494974
6045	NC_014002	ACT	2	6	312572	312577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494974
6046	NC_014002	AAGT	2	8	312690	312697	50 %	25 %	25 %	0 %	294494974
6047	NC_014002	CATG	2	8	312712	312719	25 %	25 %	25 %	25 %	294494974
6048	NC_014002	CCG	2	6	312756	312761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494974
6049	NC_014002	GCAC	2	8	312821	312828	25 %	0 %	25 %	50 %	294494974
6050	NC_014002	TGAA	2	8	312985	312992	50 %	25 %	25 %	0 %	294494974
6051	NC_014002	A	6	6	313081	313086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014002	GCG	2	6	313087	313092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014002	CCT	2	6	313161	313166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_014002	TCT	2	6	313222	313227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494975
6055	NC_014002	TG	3	6	313249	313254	0 %	50 %	50 %	0 %	294494975
6056	NC_014002	TAT	2	6	313259	313264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494975
6057	NC_014002	TCT	2	6	313286	313291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494975
6058	NC_014002	CAA	2	6	313295	313300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494975
6059	NC_014002	A	7	7	313299	313305	100 %	0 %	0 %	0 %	294494975
6060	NC_014002	TCT	2	6	313474	313479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494975
6061	NC_014002	CTT	2	6	313559	313564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494975
6062	NC_014002	CAA	2	6	313577	313582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494975
6063	NC_014002	CAT	2	6	313613	313618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494975
6064	NC_014002	T	7	7	313674	313680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014002	GGC	2	6	313724	313729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494976
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6072	NC_014002	TGC	2	6	313962	313967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494976
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6074	NC_014002	TAT	2	6	314209	314214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494977
6075	NC_014002	TGC	2	6	314304	314309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494977
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6080	NC_014002	TTTCA	2	10	314383	314392	20 %	60 %	0 %	20 %	294494977
6081	NC_014002	CTTT	2	8	314441	314448	0 %	75 %	0 %	25 %	294494977
6082	NC_014002	TA	3	6	314473	314478	50 %	50 %	0 %	0 %	294494977
6083	NC_014002	ACT	2	6	314518	314523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494977
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6087	NC_014002	CCGT	2	8	314839	314846	0 %	25 %	25 %	50 %	294494977
6088	NC_014002	ATG	2	6	314892	314897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494977
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6093	NC_014002	A	6	6	315072	315077	100 %	0 %	0 %	0 %	294494977
6094	NC_014002	TG	3	6	315080	315085	0 %	50 %	50 %	0 %	294494977
6095	NC_014002	AAT	2	6	315123	315128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494977
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6097	NC_014002	CTGG	2	8	315218	315225	0 %	25 %	50 %	25 %	294494978
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6104	NC_014002	TAT	2	6	315646	315651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494979
6105	NC_014002	TTCTT	2	10	315652	315661	0 %	80 %	0 %	20 %	294494979
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6108	NC_014002	TCTG	2	8	315930	315937	0 %	50 %	25 %	25 %	294494979
6109	NC_014002	TG	3	6	315968	315973	0 %	50 %	50 %	0 %	294494979
6110	NC_014002	GGA	2	6	315984	315989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494979
6111	NC_014002	TC	3	6	316090	316095	0 %	50 %	0 %	50 %	294494979
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6118	NC_014002	CCATT	2	10	316340	316349	20 %	40 %	0 %	40 %	294494979
6119	NC_014002	TTC	2	6	316381	316386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494979
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6122	NC_014002	AG	3	6	316416	316421	50 %	0 %	50 %	0 %	294494979
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6124	NC_014002	T	7	7	316491	316497	0 %	100 %	0 %	0 %	294494979
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6250	NC_014002	TCA	2	6	322788	322793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494988
6251	NC_014002	AAG	2	6	322794	322799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494988
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6253	NC_014002	CAC	2	6	322996	323001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494988
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6262	NC_014002	TCT	2	6	323427	323432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494988
6263	NC_014002	GGT	2	6	323593	323598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6269	NC_014002	T	7	7	323942	323948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6270	NC_014002	ATT	2	6	323956	323961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6271	NC_014002	ATA	2	6	324074	324079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494990
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6274	NC_014002	TTC	2	6	324138	324143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6295	NC_014002	TA	4	8	325281	325288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6303	NC_014002	GATAG	2	10	325863	325872	40 %	20 %	40 %	0 %	294494992
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6368	NC_014002	A	6	6	329463	329468	100 %	0 %	0 %	0 %	294494994
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6370	NC_014002	ATTTT	2	10	329505	329514	20 %	80 %	0 %	0 %	294494995
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6497	NC_014002	CGG	2	6	335882	335887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294495003
6498	NC_014002	GAT	2	6	335993	335998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294495003
6499	NC_014002	GGA	2	6	336009	336014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294495003
6500	NC_014002	TCC	2	6	336027	336032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294495003

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